一般情况下，肛门边长肉疙瘩且很痛可通过以下方法治疗：外用药物、口服药物、手术。具体如下：
一、外用药物：
1.若肛门边长肉疙瘩且很痛，患者需避免用手抓挠或触碰。可在医生指导下外用九华膏，其能起到消肿、止痛等作用，有助于肉疙瘩的好转；硝酸咪康唑乳膏可用于因真菌感染引起的情况，能缓解症状；复方醋酸地塞米松乳膏对于伴有一定炎症反应的情况有改善效果，可减轻疼痛等不适。
二、口服药物：
1.患者在外用药物同时，可在医生指导下口服湿毒清胶囊，对于体内有湿毒等因素导致的病症有一定调理作用；布洛芬缓释胶囊能起到止痛效果，缓解疼痛症状；阿奇霉素片若存在感染因素可使用，帮助控制感染，利于病情改善和身体恢复。
三、手术：
1.如果外用及口服药物都无法有效改善肛门边长肉疙瘩且很痛的状况，应及时就医。医生会根据实际情况，通过手术进行治疗，如混合痔切除术、内痔胶圈套扎术等，以去除肉疙瘩，缓解不适。
总之，当出现肛门边长肉疙瘩且很痛时，要根据具体情况选择合适的治疗方法，必要时应及时就医并遵循医生的建议进行治疗。