睡着惊醒可能由多种原因引起，比如睡眠环境因素，若睡眠环境突然有较大声响，约30%的人可能会被惊醒。
睡眠周期相关原因
浅睡眠阶段易惊醒： 人的睡眠分为浅睡眠和深睡眠阶段，在浅睡眠阶段时，大脑皮层仍有一定的兴奋性，较容易受到外界轻微刺激的影响而惊醒。成年人每晚睡眠中浅睡眠阶段大约占整个睡眠时长的50%左右，处于浅睡眠阶段时就相对更容易被唤醒。睡眠周期转换： 睡眠是一个周期循环的过程，通常一个睡眠周期约90-110分钟，在周期转换过程中，人体的神经调节等功能可能会有短暂的不稳定，此时也较容易出现惊醒的情况。比如从一个睡眠周期的深睡眠向浅睡眠转换时，就可能会有惊醒现象。
心理因素导致
压力与焦虑： 长期处于高压力状态或有焦虑情绪的人，大脑神经一直处于相对紧张的状态，即使在睡眠中，也容易出现惊醒情况。据调查，约有40%长期承受较大工作压力的人群会存在睡眠中容易惊醒的问题。比如工作中面临重大项目截止、人际关系紧张等情况时，人的心理负担重，睡眠质量受影响，易惊醒。情绪波动： 白天经历了较大的情绪起伏，如大喜、大悲等，也可能导致睡着后惊醒。例如刚经历了一场激烈的争吵，晚上睡眠时大脑还处于较为兴奋或应激的状态，就容易出现睡着后突然惊醒的状况。
疾病相关因素
睡眠呼吸暂停综合征： 这类患者会出现呼吸暂停和低通气现象，导致身体缺氧，从而引起惊醒。据统计，约有20%-30%的睡眠呼吸暂停综合征患者存在睡着后频繁惊醒的情况。患者夜间会反复出现呼吸暂停，血氧饱和度下降，身体为了纠正缺氧状态就会促使患者惊醒。心脏疾病： 某些心脏疾病，如心律失常等，也可能引发睡着惊醒。当心脏节律异常时，会影响心脏的泵血功能，导致身体供血不足，人在睡眠中就可能因为身体的不适而惊醒。例如患有心房颤动的患者，心脏跳动不规则，就容易在睡眠中出现惊醒的情况。