女性小便时小腹疼痛可能由多种原因引起，以下是一些常见的原因：
1.尿路感染：如尿道炎、膀胱炎等，细菌感染尿道后，可出现尿频、尿急、尿痛等症状，同时可能伴有小腹痛。
2.膀胱炎：膀胱位于小腹，炎症刺激可导致小腹疼痛，还可能出现尿频、尿急、尿痛等症状。
3.盆腔炎：女性内生殖器及其周围的结缔组织、盆腔腹膜发生炎症时，可引起小腹疼痛，同时可能伴有白带异常、月经不调等症状。
4.尿路结石：如膀胱结石、输尿管结石等，可导致排尿困难、尿痛，结石移动时可引起小腹疼痛。
5.妇科疾病：如宫颈炎、盆腔炎、子宫肌瘤等，也可能引起小腹疼痛，常伴有白带异常、月经失调等症状。
6.其他：如肠痉挛、腹部受凉、剧烈运动等，也可能导致小腹疼痛。
如果女性出现小便时小腹疼痛的症状，建议及时就医，进行相关检查，如尿常规、B超等，以明确病因，并在医生的指导下进行治疗。同时，女性应注意个人卫生，保持尿道口清洁，多喝水，多排尿，有助于预防尿路感染。