孕39周小腹隐隐作痛，原因包括腹部着凉、假性宫缩、胎动、产前症状等。以下具体分析：
一、腹部着凉：如果没有注重腹部保暖，腹部受冷后可能导致肠道平滑肌收缩痉挛，进而引起小腹隐隐作痛。对此可采取热毛巾热敷腹部的方法，并加强腹部保暖，通常能有效缓解症状。
二、假性宫缩：在孕39周时，因孕激素水平上升，子宫肌肉变得敏感，易出现假性宫缩，从而导致小腹隐隐作痛。这种疼痛通常不具有规律性，一般在卧床休息后症状可减轻，同时要注意避免过度劳累。
三、胎动：此时胎儿力量较大，其在宫内活动时撞击到腹壁，就可能出现小肚子隐隐作痛的情况，通常无需特别处理。
四、产前症状：孕39周胎儿已发育成熟，提前1至2周分娩是正常现象。若小腹隐隐作痛较为规律，且伴有阴道流血，则有可能是即将分娩，应及时前往医院待产。
总之，孕39周出现小腹隐隐作痛时，要仔细分辨原因，必要时及时就医，以确保孕妇和胎儿的健康安全。