吃了紧急避孕药后小腹微微疼已经五天了，可能是以下原因引起：
1.药物副作用：紧急避孕药中含有大量的孕激素，服用后可能会引起恶心、呕吐、头痛、乳房胀痛、腹痛等症状，一般不需要特殊处理，症状会在24-48小时内自行缓解。
2.撤退性出血：服用紧急避孕药后，可能会出现撤退性出血，一般出血量较少，持续时间较短，可伴有下腹疼痛。
3.盆腔炎：如果本身就有盆腔炎，服用紧急避孕药后可能会加重病情，导致下腹疼痛、坠胀、腰骶部酸痛等症状。
4.其他：异位妊娠、先兆流产等也可能会引起小腹疼痛。
如果小腹疼痛持续不缓解，或伴有阴道出血量多、发热等症状，应及时就医，进行相关检查，如B超、血HCG等，以明确病因，并在医生的指导下进行治疗。
此外，需要注意的是，紧急避孕药不能作为常规的避孕方法，其副作用较大，且避孕成功率并不是100%。建议在无保护性生活后72小时内服用紧急避孕药，但越早服用效果越好。同时，应注意观察月经情况，如果月经推迟超过1周，应及时进行验孕检查，以排除怀孕的可能。如果短期内没有生育计划，应采取其他有效的避孕措施，如避孕套、节育环等。