生理期腰疼比较常见，据统计，约有60% - 80%的女性在生理期会出现不同程度的腰疼。
激素变化导致
生理期时，女性体内的激素水平会发生变化，尤其是前列腺素分泌增加。前列腺素增多会引起子宫平滑肌收缩，同时也可能会影响到腰部的肌肉和筋膜，导致腰部出现疼痛不适。一般这种疼痛在月经来潮的前1 - 2天开始出现，随着月经的结束会逐渐缓解。
盆腔充血影响
生理期时盆腔处于充血状态，这种充血可能会波及到腰部周围的组织，进而引起腰疼。女性盆腔与腰部相邻，盆腔充血会对腰部的神经等产生一定的刺激，导致腰部出现坠胀感和疼痛感。而且如果本身有盆腔炎等基础疾病，生理期时盆腔充血会使炎症症状加重，腰疼也会更明显。
子宫位置异常所致
部分女性子宫位置异常，比如后位子宫，在生理期时，子宫收缩排出经血的过程中，由于子宫位置的特殊，可能会对周围组织产生牵拉，从而引发腰疼。这种情况在一些先天性子宫位置发育异常的女性中较为常见，而且可能会伴随月经血排出不畅等问题。
腰部肌肉劳损叠加
有些女性平时就有腰部肌肉劳损的情况，在生理期时，由于身体的整体状态改变，比如激素变化、盆腔充血等因素，会使得腰部肌肉劳损的症状被放大，从而出现更明显的腰疼。例如本身长期久坐、久站或者从事重体力劳动的女性，生理期时腰疼往往会比其他人更严重。