怀孕三个月的流产方式主要有以下几种：
一、药物流产加清宫手术：遵医嘱服用米非司酮或米索前列醇等药物，先将胚胎杀死，促使子宫收缩，使胚胎和胎盘逐渐排出，同时需及时进行清宫手术，将残留物质清理干净，以此达到流产目的。
1.米非司酮：是一种孕激素拮抗剂，能与孕激素受体结合，阻断孕激素的作用，从而使胚胎失去孕激素的支持而死亡。
2.米索前列醇：可引起子宫收缩，帮助排出死亡的胚胎和胎盘。
二、引产：怀孕三个月后胎儿已逐渐发育长大且有明显骨骼，可采取引产方式流产，相对较为彻底。引产方法主要有药物引产，如利凡诺引产或使用钳刮术。
1.利凡诺引产：将利凡诺注入羊膜腔内，引起子宫收缩，促使胎儿和胎盘排出。
2.钳刮术：通过手术器械将胎儿和胎盘钳出。
此外，流产后要注意以下方面：流产后1个月内要多休息，可适当活动，但不可剧烈运动，不能有性生活，避免劳累、熬夜等。饮食上应清淡，避免进食辛辣刺激食物，以免影响恢复。
总结：怀孕三个月流产可选药物流产加清宫或引产，流产后要注意休息、活动、性生活等方面的限制，以及饮食的调整。