怀孕肚子会痛主要有以下原因：一是胚胎着床，二是子宫增大，三是病理因素。
一、胚胎着床。当受精卵形成后会从输卵管运行至子宫腔，并在子宫内膜着床发育，这一过程可能对着床部位产生刺激，导致子宫收缩，进而引发肚子疼痛。不过这种疼痛通常并不严重，程度不会超过平时的痛经。
二、子宫增大。伴随胚胎的不断生长发育，子宫为了适应其需求也会逐渐增大，子宫肌纤维会持续拉伸，从而刺激到神经，致使出现肚子疼痛现象。
三、病理因素。例如出现先兆流产、宫外孕等情况时，都有可能在怀孕期间出现肚子疼的状况，此时需要尽快前往医院进行诊治。
总之，怀孕时肚子痛的原因多样，需根据具体情况进行分析判断，如有异常应及时就医。