怀孕肚子会痛主要有以下原因：一是胚胎着床，二是子宫增大，三是存在病理因素。
一、胚胎着床。当受精卵形成后会从输卵管运行至子宫腔，然后在子宫内膜着床发育，此过程可能会对着床部位产生刺激，进而引发子宫收缩，从而导致肚子疼痛，不过通常这种疼痛并不严重，不会超出平时痛经的程度。
二、子宫增大。随着胚胎不断生长发育，子宫也需要增大来适应，这时子宫肌纤维会持续拉伸，神经受到刺激，也就出现了肚子疼痛。
三、病理因素。比如先兆流产、宫外孕等情况，都有可能使孕妇在怀孕期间出现肚子疼的现象，此时需要及时前往医院就诊。
总之，怀孕时肚子痛的原因多样，需要仔细甄别，尤其是出现异常疼痛时要及时就医检查。