新生儿巨细胞病毒感染主要是由母婴传播引起的。宫内感染是新生儿巨细胞病毒感染的重要途径，约有10% - 15%的宫内感染胎儿会出现症状。
母婴传播途径一：宫内感染
胎盘传播： 孕妇初次感染巨细胞病毒后，病毒可通过胎盘传播给胎儿。如果孕妇在孕期感染了巨细胞病毒，病毒会经过血液循环通过胎盘到达胎儿体内，进而感染胎儿的多个器官和系统。例如，胎儿的肝脏、脾脏、肺脏等都可能受到病毒侵袭，影响胎儿的正常发育。上行感染： 孕妇宫颈部位的巨细胞病毒也可能在分娩过程中感染新生儿。当胎儿通过产道时，接触到含有巨细胞病毒的宫颈分泌物，从而被感染。这种情况相对宫内感染的比例相对低一些，但也是新生儿感染的一个重要方式。
母婴传播途径二：产道感染
在分娩过程中，新生儿接触到母亲产道中的巨细胞病毒，从而被感染。虽然胎儿在宫内可能未被感染，但在经过产道时，暴露于含有病毒的环境中，就有被感染的风险。
母婴传播途径三：产后感染
产后新生儿与母亲密切接触，母亲的唾液、乳汁等也可能含有巨细胞病毒。例如，母亲通过亲吻新生儿、用自己的嘴尝试食物温度后喂给新生儿等方式，都可能将巨细胞病毒传染给新生儿。有研究表明，约10% - 30%的产后感染是通过母乳喂养传播的，母乳中的巨细胞病毒可在新生儿胃肠道内复制，进而感染新生儿。