引起肛门湿疹的原因较多，比如局部因素中，肛门局部卫生不佳是常见原因之一，据统计，约有40%的肛门湿疹患者是因为不注意肛门局部清洁引发的。
局部因素相关
肛周皮肤病变： 肛周患有痔疮、肛裂、肛瘘等疾病时，会导致分泌物增多，刺激肛周皮肤，从而引发肛门湿疹。例如痔疮患者，痔核脱出后会带出肠道分泌物，长期刺激肛周皮肤，就容易诱发湿疹。衣物材质不适： 穿着化纤材质的内裤，或者内裤过紧不透气，会使肛周皮肤长时间处于潮湿、不透气的环境中，增加肛门湿疹的发病几率。比如一些人长期穿紧身的化纤内裤，肛周皮肤总是被汗液和分泌物浸润，就容易出现湿疹症状。
全身因素相关
过敏性体质： 本身是过敏性体质的人，接触到某些过敏原时，容易引发肛门湿疹。常见的过敏原包括食物（如鱼虾、蛋类、牛奶等）、药物（如某些抗生素、解热镇痛药等）、花粉、尘螨等。例如对海鲜过敏的人，食用海鲜后可能会出现全身过敏反应，也可能累及肛周皮肤引发湿疹。消化系统疾病： 患有消化不良、肠道寄生虫病、胃肠功能紊乱等消化系统疾病时，会影响身体的正常代谢和吸收功能，导致体内毒素堆积，从而诱发肛门湿疹。比如肠道寄生虫病患者，虫体的代谢产物等可能会作为过敏原，引起肛周皮肤的过敏反应，进而引发湿疹。
环境因素相关
气候影响： 在炎热潮湿的季节，人体出汗较多，肛周皮肤容易潮湿，若不及时清洁和保持干燥，就容易引发肛门湿疹。比如在夏季，气温高湿度大，很多人会出现肛门湿疹的情况。职业因素： 某些职业需要长期久坐、久站，且肛周局部不透气，如煤矿工人、汽车司机等，这类人群肛门湿疹的发病率相对较高。因为长期处于这样的工作环境中，肛周皮肤长时间受到压迫和不透气的影响，容易出现湿疹。