肾积水通常是由尿路梗阻导致尿液排出受阻引起的。比如，约有80%的肾积水是由于尿路结石造成的梗阻引发的。
一、泌尿系统自身病变引起
肾盂输尿管连接部狭窄：这是比较常见的先天性因素，胎儿在发育过程中，肾盂和输尿管连接的部位出现狭窄，就会阻碍尿液从肾盂流入输尿管，长期下去就会导致肾积水。一般这种情况在儿童中相对多见。输尿管结石：当输尿管内有结石时，结石会堵塞输尿管，使得尿液无法顺利通过，进而引起肾积水。结石可能是原发在输尿管的，也可能是肾脏结石掉到输尿管里的。
二、外部压迫导致
腹腔内肿瘤压迫：像胃肠道的肿瘤、妇科的肿瘤等，当肿瘤生长到一定大小，就可能压迫到输尿管，从而引起肾积水。例如，较大的卵巢囊肿可能会压迫到一侧的输尿管，导致该侧肾脏出现积水情况。盆腔粘连：盆腔部位的炎症、手术等原因导致粘连，也可能会压迫输尿管，影响尿液的正常排出，引发肾积水。比如有过盆腔手术史的患者，术后发生盆腔粘连的概率相对较高，就可能出现肾积水。
三、神经性因素
神经源性膀胱：这是由于神经系统病变导致膀胱功能障碍，使得尿液不能正常从膀胱排出，进而反流到输尿管、肾盂，引起肾积水。常见于脊髓损伤、糖尿病神经病变等患者，这类患者膀胱排尿无力，尿液潴留，容易引发肾积水。