脊髓空洞的治疗需根据具体情况来定，一般来说，手术是主要的治疗手段之一，如后颅窝减压术等，大约70%左右的患者通过手术能改善症状。
手术治疗为主
枕骨大孔减压术：适用于因颅颈交界区畸形导致脊髓空洞的患者，通过扩大枕骨大孔及上颈椎椎板，减轻对脊髓的压迫，改善脑脊液循环。一般手术时间约2~3小时，术后需住院观察1~2周。脊髓空洞分流术：将脊髓空洞与蛛网膜下腔或腹腔等部位分流，使空洞内液体引流到其他腔隙，缓解空洞对脊髓的压迫。手术效果因个体差异有所不同，部分患者术后空洞缩小，症状减轻。
药物辅助治疗
神经营养药物：常用的有维生素B1、维生素B12等，可营养神经，促进神经功能恢复，一般需长期服用，每日按常规剂量服用维生素B1和维生素B12。止痛药物：当患者出现疼痛症状时，可使用布洛芬等非甾体抗炎药来缓解疼痛，但需注意布洛芬可能引起胃肠道不适等副作用，需在医生指导下使用。
康复治疗配合
物理治疗：包括针灸、按摩、理疗等。针灸可选择相关穴位刺激，促进神经功能恢复，一般每周进行2~3次针灸治疗；按摩要由专业人员操作，每日可进行1~2次，每次15~20分钟；理疗如经皮电刺激等，可改善局部血液循环，辅助神经功能恢复。康复训练：根据患者病情进行针对性的康复训练，如肢体的运动功能训练，对于有肢体活动障碍的患者，每天需进行一定时间的训练，从简单的肢体屈伸动作开始，逐渐增加难度和强度，每次训练30分钟左右，每周训练5天以上。