巩膜炎的病因较为复杂，可能与多种因素相关。一般来说，自身免疫性疾病是引发巩膜炎的常见原因之一，比如约1/3的巩膜炎患者可能与类风湿关节炎等自身免疫性疾病有关。
自身免疫性疾病相关
类风湿关节炎关联： 类风湿关节炎患者发生巩膜炎的风险相对较高，研究发现约有一定比例的类风湿关节炎患者会并发巩膜炎，但具体比例因不同研究略有差异。这类患者体内免疫系统异常，攻击自身组织，进而累及巩膜引发炎症。系统性红斑狼疮关联： 系统性红斑狼疮也是导致巩膜炎的自身免疫性疾病之一，患者自身的免疫复合物沉积在巩膜组织中，激活免疫反应，引起巩膜炎症。
感染因素导致
细菌感染： 某些细菌感染可引发巩膜炎，比如肺炎链球菌、金黄色葡萄球菌等细菌感染眼部周围组织后，可能蔓延至巩膜，导致巩膜出现炎症反应。病毒感染： 单纯疱疹病毒、带状疱疹病毒等病毒感染也可能与巩膜炎的发生有关。例如，单纯疱疹病毒感染眼部后，有可能侵犯巩膜，引发巩膜的炎症病变。
局部邻近组织炎症蔓延
角膜炎蔓延： 角膜炎如果没有得到及时有效的治疗，炎症可能会向周围组织蔓延，包括波及巩膜，从而引发巩膜炎。比如一些严重的细菌性角膜炎、病毒性角膜炎等，炎症扩散可能累及巩膜。葡萄膜炎蔓延： 葡萄膜炎与巩膜相邻，葡萄膜炎的炎症也有可能向巩膜扩展，导致巩膜炎的发生。例如，一些自身免疫性葡萄膜炎患者，炎症可能累及巩膜部位。
代谢性疾病影响
痛风相关： 痛风患者体内尿酸代谢异常，尿酸盐结晶可能沉积在巩膜等组织中，刺激巩膜引发炎症反应。痛风患者如果尿酸控制不佳，就有较高的巩膜炎发病风险。糖尿病相关： 糖尿病患者长期高血糖状态可能影响眼部的血液循环和代谢，使得巩膜组织的营养供应和代谢平衡受到干扰，增加巩膜炎的发生几率。