膀胱炎主要由细菌感染引起，大约80%的膀胱炎是由大肠埃希菌等肠道细菌逆行感染所致。
细菌感染途径
上行感染： 这是最常见的感染途径。细菌经尿道进入膀胱，比如女性尿道短而直，距离肛门较近，大肠杆菌等细菌更容易从尿道上行进入膀胱引发感染。据统计，女性膀胱炎的发病率明显高于男性，与女性的生理结构有很大关系。血行感染： 较少见。身体其他部位的感染病灶，如皮肤感染、扁桃体炎等，细菌可通过血液循环到达膀胱引起感染，但这种情况相对比较少见。
自身抵抗力因素
免疫力低下人群： 当人体免疫力下降时，比如患有糖尿病、艾滋病等疾病，或者长期使用免疫抑制剂的人群，身体抵御细菌的能力减弱，更容易患上膀胱炎。例如，糖尿病患者由于血糖控制不佳，尿液中含糖量高，为细菌生长提供了良好的环境，从而增加了膀胱炎的发病风险。局部抵抗力降低： 比如绝经后的女性，体内雌激素水平降低，尿道黏膜变薄，局部抵抗力下降，容易发生膀胱炎。另外，长期憋尿也会使膀胱黏膜处于缺血状态，局部抵抗力降低，增加细菌感染的机会。
医源性因素
导尿等操作： 进行导尿、膀胱镜检查等医疗操作时，如果消毒不严格，可能会将细菌带入膀胱，引起膀胱炎。据相关研究，短期导尿引起膀胱炎的发生率约为1% - 5%，长期留置导尿管的患者，膀胱炎的发生率会大大增加，可达90%以上。膀胱造瘘等手术： 进行膀胱造瘘等手术时，也可能因为操作过程中的细菌污染导致膀胱炎的发生。