怀孕两个月时出现褐色分泌物时有时无的情况，可能是多种原因引起的。一般来说，这种情况可能与先兆流产、胚胎着床出血、宫颈病变等有关。
先兆流产相关情况
胚胎发育因素： 如果胚胎本身存在染色体异常等问题，就可能导致先兆流产，出现褐色分泌物。这种情况在怀孕早期并不少见，据统计，约有15% - 20%的孕妇在孕早期会出现先兆流产相关症状。黄体功能不全： 怀孕后黄体分泌的孕激素对维持妊娠至关重要。如果黄体功能不全，孕激素分泌不足，就难以很好地支持子宫内膜，容易引起子宫少量出血，表现为褐色分泌物时有时无。
胚胎着床出血情况
着床过程： 在怀孕早期，胚胎着床时可能会导致子宫内膜局部小血管破裂出血，这种出血量通常较少，表现为褐色分泌物，一般持续时间较短，但也可能时有时无。通常发生在受精后6 - 12天左右，不过个体差异较大。
宫颈病变情况
宫颈炎： 孕妇本身有宫颈炎时，宫颈部位的黏膜比较脆弱，容易在孕期受到激素影响等因素刺激而出血，血液混合白带就可能呈现褐色分泌物，且可能时有时无。宫颈息肉： 宫颈上的息肉组织比较娇嫩，怀孕后由于激素变化等原因，息肉可能会有少量出血，从而出现褐色分泌物时有时无的情况。