胃肠功能紊乱常见的症状有消化系统方面的表现，比如约50%的患者会出现食欲不振，进食量明显减少。还会有腹痛症状，腹痛部位不固定，多在脐周，一般疼痛程度较轻，可忍受。
消化系统症状表现
腹胀： 患者常感觉腹部胀满，尤其是饭后明显，有的患者腹胀会持续数小时甚至一整天。恶心呕吐： 部分胃肠功能紊乱患者会出现恶心，严重时可伴有呕吐，呕吐物多为胃内容物，一般无血性物质。
肠道功能紊乱表现
腹泻： 每日排便次数可能增多，可达3 - 5次甚至更多，大便多为稀糊状，有时呈水样便，但一般无脓血。便秘： 与腹泻相反，有的患者会出现排便困难，大便干结，数天一次排便，排便时费力。
全身伴随症状
失眠多梦： 约30% - 40%的胃肠功能紊乱患者会出现睡眠问题，表现为入睡困难、多梦易醒等。焦虑抑郁： 长期受胃肠功能紊乱困扰的患者，容易出现焦虑、抑郁情绪，尤其是病情反复时，焦虑抑郁情绪可能会加重，影响生活质量。