胃肠道功能紊乱常见的症状有很多，比如消化系统方面，患者可能会出现食欲不振，大约有30% - 50%的胃肠道功能紊乱患者会有不同程度的食欲减退情况；还可能出现恶心呕吐，偶尔会在无明显诱因下发生呕吐，呕吐物多为胃内容物。
消化系统的典型症状
腹痛： 腹痛是比较常见的症状之一，疼痛部位不固定，一般以下腹部多见，疼痛程度轻重不一，有的患者是隐痛，有的可能是胀痛，疼痛时间也不固定，可能持续几分钟到几小时不等。腹胀： 患者会感觉腹部胀满，尤其是在进食后腹胀会更加明显，有的患者腹胀可持续数小时甚至数天，自己能明显感觉到肚子比平时大。
肠道功能相关症状
腹泻： 每天排便次数可能会增多，一般在3 - 5次左右，严重的可能达到10次以上，大便性状多为稀便或水样便，但一般没有脓血。便秘： 与腹泻相反，有的患者会出现排便困难，排便次数减少，每周排便少于3次，大便干结，排出费力。
全身伴随症状
精神症状： 部分患者会伴有精神方面的症状，比如焦虑、抑郁，大约有20% - 30%的胃肠道功能紊乱患者会出现不同程度的情绪问题，表现为情绪低落、烦躁不安、对事物缺乏兴趣等。疲劳乏力： 患者会感觉全身没有力气，容易疲劳，即使经过休息也不能很好地缓解，这种疲劳感会影响患者的日常生活和工作，大约有40%左右的患者会有明显的疲劳乏力表现。