大便便不尽可能由多种原因造成。比如肠道炎症性疾病，像溃疡性结肠炎，约有10% - 20%的患者会出现便不尽感，同时还可能伴有腹痛、黏液脓血便等症状；克罗恩病也可能导致便不尽，一般病程较长，会有腹痛、腹泻、体重下降等表现。
肠道疾病因素
肠道炎症：除了溃疡性结肠炎和克罗恩病，细菌性痢疾也会引起便不尽。患者通常在1 - 2周内有不洁饮食史，出现腹痛、腹泻、里急后重（即便不尽感）、黏液脓血便等症状。肠道肿瘤：结直肠癌也可能导致大便便不尽。中老年人相对更易患病，除了便不尽，还可能有大便习惯改变、便血、消瘦等表现，早期可能症状不典型，随着病情进展会逐渐明显。
肛门直肠疾病因素
痔疮：尤其是内痔发展到一定程度时，可能会出现便不尽感。Ⅱ - Ⅲ度内痔患者，痔核脱出肛门外，会刺激直肠黏膜，产生便意频繁但又排不净的感觉。直肠脱垂：也叫脱肛，是直肠壁部分或全层向下移位。患者会有排便不尽感，同时可看到直肠黏膜自肛门脱出，初期可自行还纳，后期需用手还纳甚至无法还纳。
功能性因素
肠易激综合征：这是一种常见的功能性肠病，约有30% - 50%的患者会出现便不尽感。发病与胃肠动力异常、内脏高敏感、精神心理因素等有关，症状可在排便后部分缓解，常伴有腹痛、腹胀等症状，且症状会随情绪变化而波动。盆底肌功能紊乱：比如盆底肌痉挛综合征，会导致排便时盆底肌不能正常松弛，从而出现便不尽感，患者排便困难，用力排便后仍有残留感。