一般情况下，月经期最后两天流褐色分泌物是绝对不可以同房的。主要原因如下：
一、此时月经尚未完全干净，子宫内膜也没有完全修复，若此时同房，容易导致患者月经回潮。
1.月经回潮可能会引起月经周期的紊乱，使下次月经的时间变得不规律。
2.还可能导致月经出血量异常，可能增多或减少。
二、月经期女性抵抗力较低，若在最后两天流褐色分泌物时同房，极易滋生细菌，从而引发一系列妇科疾病，如盆腔炎、子宫内膜炎、子宫内膜异位症、阴道炎等。
1.盆腔炎会导致下腹疼痛、坠胀，伴有发热、白带增多等症状。
2.子宫内膜炎可引起下腹疼痛、月经异常、白带异常等表现。
3.子宫内膜异位症可能导致痛经、性交痛、不孕等问题。
4.阴道炎则会出现阴道瘙痒、白带异常等不适。
在日常生活中，要注意以下几点：
1.保持清洁健康的性生活，同房时采取合适的保护措施。
2.月经期严禁同房。
3.饮食上避免食用辛辣生冷刺激的食物，尽量清淡饮食。
4.注意休息，保证充足的睡眠。
总之，在月经期最后两天流褐色分泌物时，为了女性的身体健康，一定不能同房，同时要做好日常的保健护理。