月经期最后两天流褐色分泌物时，不建议同房。以下是原因：
1.容易感染：月经期女性子宫内膜脱落，宫腔内有新鲜创面，宫颈口也处于扩张状态。此时同房，男性生殖器可能会把细菌带入阴道，经血是细菌等微生物的良好培养基，细菌极易滋生，沿子宫内膜内许多微小伤口和破裂的小血管扩散，感染子宫内膜，甚至可累及输卵管和盆腔器官，从而给女方带来不必要的麻烦。
2.导致经期延长和月经量增多：经期延长和月经量增多可能与经期同房时，女性性兴奋时子宫收缩，将子宫内膜碎片挤入盆腔有关。
3.引起子宫内膜异位症：经期同房，精子在子宫内膜破损处和溢出的血细胞相遇，甚至进入血液，可诱发抗精子抗体的产生，从而导致免疫性不孕、不育症。
4.其他：还可能导致阴道或盆腔炎症。
需要注意的是，以上情况并非适用于所有女性。如果女性本身患有妇科疾病，如阴道炎、宫颈炎等，经期同房可能会加重病情。此外，经期同房还可能导致经血逆流，增加子宫内膜异位症的风险。因此，对于经期同房的问题，应该根据个人情况谨慎决定。如果有任何疑虑或担忧，建议咨询医生的意见。同时，为了女性的健康，建议在经期避免同房。