溃疡性结肠炎的治疗药物需根据病情等因素选择，常用的有效药物包括氨基水杨酸制剂、糖皮质激素、免疫抑制剂等。氨基水杨酸制剂中，柳氮磺吡啶是常用药物，约70%左右的轻、中度患者使用后能得到缓解。
氨基水杨酸制剂：
柳氮磺吡啶： 是治疗轻、中度溃疡性结肠炎的常用药物，它能抑制炎症介质的产生，发挥抗炎作用。一般需连续服用数周才能见效。美沙拉嗪： 也是氨基水杨酸制剂的一种，有口服剂型和灌肠剂型。口服美沙拉嗪适用于病变累及全结肠的患者；灌肠剂型的美沙拉嗪则主要针对直肠和乙状结肠部位的病变，能直接作用于肠道局部，起效相对较快。
糖皮质激素：
泼尼松： 对于氨基水杨酸制剂疗效不佳的中、重度患者，可使用糖皮质激素。泼尼松能迅速减轻炎症反应，但长期使用可能会有较多副作用，如骨质疏松、感染风险增加等，一般在病情得到控制后需逐渐减量。氢化可的松： 重症患者可能会静脉使用氢化可的松来快速控制炎症，但同样需要注意其可能带来的副作用，如血糖升高、消化道溃疡等风险。
免疫抑制剂：
硫唑嘌呤： 适用于对糖皮质激素治疗效果不佳或依赖的患者，以及部分重度溃疡性结肠炎患者。它需要较长时间（数周甚至数月）才能发挥作用，用药期间需定期监测血常规等指标，因为可能会引起骨髓抑制等不良反应。巯嘌呤： 与硫唑嘌呤作用机制类似，也可用于溃疡性结肠炎的治疗，尤其适用于对其他药物反应不佳的患者，使用时同样要关注血常规等指标的变化。
生物制剂：
英夫利昔单抗： 对于传统治疗无效的重度溃疡性结肠炎患者，生物制剂可能是一种选择。它通过特异性结合肿瘤坏死因子等炎症因子发挥作用，但使用前需要进行严格的评估，因为可能会增加感染等风险，且费用相对较高。