溃疡性结肠炎的治疗药物需根据病情选择，常用的有氨基水杨酸制剂、糖皮质激素、免疫抑制剂等。一般来说，氨基水杨酸制剂中的5-氨基水杨酸类药物较为常用，比如美沙拉嗪，它能在肠道局部发挥作用，缓解炎症，通常需要较长时间服用，可能连续服用数月。
氨基水杨酸制剂：
柳氮磺吡啶： 是常用的氨基水杨酸制剂，它在肠道内分解为5-氨基水杨酸和磺胺吡啶，5-氨基水杨酸可抑制炎症介质的产生，起到抗炎作用，但可能会引起恶心、呕吐等胃肠道反应。美沙拉嗪： 局部作用于结肠黏膜，抗炎效果较好，副作用相对较少，口服剂型一般需要规律服用，比如每天分几次服用，持续数周甚至数月。
糖皮质激素：
泼尼松： 属于全身性应用的糖皮质激素，对于中重度溃疡性结肠炎急性发作有较好的抗炎作用，能快速缓解症状，但长期使用可能会有较多副作用，像骨质疏松、感染风险增加、血糖升高等。布地奈德： 是局部作用的糖皮质激素，主要作用于肠道局部，全身副作用相对较小，适用于左半结肠型的溃疡性结肠炎，一般服用数周。
免疫抑制剂：
硫唑嘌呤： 可用于激素治疗无效或依赖的患者，需要较长时间起效，通常服用3-6个月才会逐渐发挥作用，可能会出现骨髓抑制等不良反应，用药期间需要定期监测血常规等指标。巯嘌呤： 作用机制与硫唑嘌呤类似，也用于病情反复的溃疡性结肠炎患者，同样需要注意血常规等指标的监测，可能会有胃肠道不适等反应。
生物制剂：
英夫利西单抗： 对于传统治疗无效的重度溃疡性结肠炎患者可能有效，需要通过静脉输注给药，一般是按照一定的疗程进行使用，比如间隔几周输注一次，但价格相对较高，且可能会有感染等风险。