白塞氏病的具体病因目前尚未完全明确，但研究发现可能与以下因素有关。目前认为遗传因素可能起到一定作用，有研究显示白塞氏病患者中部分存在特定基因的关联，比如人类白细胞抗原（HLA）-B51基因在白塞氏病患者中的阳性率较高，有资料表明在一些白塞氏病患者群体中，HLA-B51基因阳性率可达到50%~90%左右。
遗传因素相关
基因关联情况： 除了HLA-B51基因外，还有其他一些基因也可能与白塞氏病的发病有一定关系，但具体机制还在进一步研究中。比如一些免疫相关基因的突变或多态性变化可能影响机体的免疫调节功能，从而增加患白塞氏病的风险。遗传易感性表现： 具有遗传易感性的人并不一定会必然发病，只是相对其他人来说，发病的概率可能会有所升高，但环境等因素也起到重要的触发作用。
感染因素影响
病毒感染方面： 有研究推测单纯疱疹病毒、巨细胞病毒等病毒感染可能与白塞氏病的发病有关。例如，单纯疱疹病毒感染可能会引起机体免疫反应的异常激活，导致免疫系统攻击自身组织，进而诱发白塞氏病相关的炎症反应。细菌感染影响： 某些细菌感染，比如链球菌感染等，也可能通过引发机体的免疫交叉反应，导致白塞氏病的发生。当人体感染了相关细菌后，免疫系统识别错误，将自身组织当作外来病原体进行攻击，从而出现血管炎等一系列白塞氏病的病理表现。
免疫异常机制
免疫系统紊乱表现： 白塞氏病患者存在免疫系统的异常激活，体内的T淋巴细胞、B淋巴细胞等免疫细胞功能出现失调。例如，T淋巴细胞会分泌过多的细胞因子，像干扰素-γ、肿瘤坏死因子-α等，这些细胞因子会引起血管的炎症反应，导致血管壁受损、通透性增加等，进而出现白塞氏病患者常见的口腔溃疡、生殖器溃疡、眼部炎症等症状。自身抗体产生： 部分白塞氏病患者体内会产生一些自身抗体，这些自身抗体参与了自身免疫性炎症的过程，进一步加重了血管及周围组织的炎症损伤，促使白塞氏病的病情发展。