白塞氏病的具体病因目前还不完全明确，可能与遗传因素、感染因素以及免疫异常等多方面有关。有研究显示，遗传因素在白塞氏病的发病中起到一定作用，某些特定的基因位点与白塞氏病的易感性相关，比如人类白细胞抗原（HLA）-B51基因，携带该基因的人群患白塞氏病的风险相对较高，据统计，白塞氏病患者中HLA-B51基因阳性率可达到50%~90%。
遗传因素相关情况
基因关联： 前面提到的HLA - B51基因是比较明确与白塞氏病相关的基因。除了HLA - B51基因外，还有其他一些基因也可能参与白塞氏病的发病机制，但具体关联还在不断研究中。遗传易感性： 如果家族中有白塞氏病患者，那么家族其他成员患白塞氏病的风险会比普通人群高一些，但并不是说一定会发病，只是有一定的遗传易感性。
感染因素方面
病毒感染： 有研究认为病毒感染可能是诱发白塞氏病的因素之一。比如单纯疱疹病毒、巨细胞病毒等，这些病毒感染人体后，可能会引发机体的免疫反应异常，从而导致白塞氏病相关症状的出现。细菌感染： 某些细菌感染也可能和白塞氏病有关，像链球菌、结核杆菌等感染。例如，有部分白塞氏病患者在发病前有过结核杆菌感染的病史，当机体感染这些细菌后，可能会激活免疫系统，导致免疫系统紊乱，进而引发白塞氏病。
免疫异常情况
免疫系统紊乱： 白塞氏病患者存在明显的免疫异常。患者体内的免疫系统会出现过度激活的情况，导致大量炎症因子释放。例如，肿瘤坏死因子 - α、白细胞介素 - 2等炎症因子水平会升高，这些炎症因子会引起血管的炎症反应，从而出现白塞氏病的一系列症状，如口腔溃疡、生殖器溃疡、眼部炎症等表现。自身抗体产生： 部分白塞氏病患者体内会产生自身抗体，这些自身抗体可以攻击自身的组织和器官，进一步加重炎症反应和组织损伤，使得病情持续发展。