宝宝反复高烧40度两天，可能由多种原因引起，以下是一些可能的情况和建议：
1.感染：这是最常见的原因，如病毒、细菌、支原体等感染都可能导致高烧。可以观察宝宝是否有其他症状，如咳嗽、流鼻涕、喉咙痛、腹泻等。如果有，需要及时就医，医生可能会根据症状和检查结果开一些抗生素或抗病毒药物。如果没有其他症状，也可以先在家观察，多喝水，注意宝宝的精神状态。如果宝宝出现高热惊厥、呼吸急促、嗜睡等异常情况，应立即就医。
2.免疫系统问题：宝宝的免疫系统尚未完全发育成熟，可能会对某些抗原产生过度反应，导致自身免疫性疾病或过敏反应。这些情况可能会引起反复高烧。如果宝宝有湿疹、哮喘、食物过敏等病史，或者家族中有免疫系统疾病患者，需要及时告知医生。医生可能会进行一些相关的检查，如血常规、免疫球蛋白、过敏原检测等，以明确诊断。
3.其他疾病：除了上述情况外，还有一些其他疾病也可能导致反复高烧，如恶性肿瘤、血液系统疾病、结缔组织病等。这些情况相对较少见，但需要排除。如果宝宝有其他异常表现，如淋巴结肿大、皮肤出血点、关节疼痛等，或者高烧持续时间过长（超过3天），应及时就医，进行全面的检查和诊断。
4.疫苗接种反应：有些疫苗接种后可能会出现短暂的发热反应，一般在接种后24小时内出现，体温通常不会超过38.5度，而且持续时间不会太长。如果宝宝在接种疫苗后出现高烧，需要观察宝宝的情况，如果精神状态良好，可以先在家观察，多喝水，物理降温。如果体温超过38.5度或持续时间较长，或伴有其他不适症状，应及时就医。
总之，宝宝反复高烧40度两天是一个比较严重的情况，需要引起重视。家长应密切观察宝宝的情况，及时就医，以便明确病因，采取相应的治疗措施。同时，家长也要注意给宝宝多喝水，保持室内通风，避免过度包裹，注意宝宝的个人卫生，以帮助宝宝尽快恢复健康。