生殖器官疼痛可能与外伤、尿路感染、阴茎海绵体感染、尿道有结石等相关，其治疗可采取药物治疗、手术治疗等方式。
原因具体如下：
一、外伤导致：若局部曾经受过伤，或者在进行医源性操作时，往往会引发短期的疼痛。
二、尿路感染：当发生尿路感染时，会导致患者尿道内疼痛以及排尿疼痛，进而引起生殖器疼痛。
三、阴茎海绵体的感染：阴茎海绵体一旦产生炎症、脓肿等情况，会造成勃起时出现疼痛或是产生持续性疼痛。
四、尿道有结石：尿道内存在结石，在排尿过程中不仅会产生疼痛，还会伴有向阴茎放射的疼痛。
治疗方案详细情况为：
一、药物治疗：
1.如果阴茎痛是由泌尿生殖道感染引起的，可进行抗生素治疗。
2.如果是包皮龟头发生感染而导致的疼痛，可使用如红霉素之类的抗生素软膏。当然，使用药物必须要在医生的指导下进行。
二、手术治疗：若是因为阴茎硬结症而产生的疼痛，可通过手术切除局部硬结，这样能够逐渐达到缓解疼痛的目的。
总之，当出现生殖器官疼痛时，应及时明确原因，并根据具体情况选择合适的治疗方法，以有效缓解疼痛症状。