小肚子和肛门连着一起疼，可能是以下原因引起：
1.肛裂：肛管皮肤全层纵行裂开并形成感染性溃疡，可引起肛门疼痛，同时可放射至下腹或腰骶部，导致小肚子疼痛。
2.肛周脓肿：直肠肛管周围软组织或其周围间隙发生的急性化脓性感染，并形成脓肿，可引起肛门疼痛，同时可伴有发热、乏力等全身症状，炎症扩散可引起小肚子和肛门连着一起疼。
3.肛窦炎：肛窦炎是指肛窦发生的急慢性炎症，可引起肛门疼痛，同时可伴有肛门下坠感、排便不尽感等症状，炎症扩散可引起小肚子和肛门连着一起疼。
4.溃疡性结肠炎：病因尚不明确，可能与环境、遗传、肠道微生态、免疫等因素有关，可导致直肠、结肠黏膜出现溃疡性损伤，引起腹痛、腹泻、黏液脓血便等症状，同时可伴有肛门疼痛。
5.克罗恩病：病因尚不明确，可能与环境、遗传、感染等因素有关，可导致胃肠道全层炎症，引起腹痛、腹泻、瘘管形成等症状，同时可伴有肛门疼痛。
6.肠易激综合征：病因尚不明确，可能与胃肠动力学异常、内脏感觉异常、精神心理因素等有关，可导致腹痛、腹胀、腹泻等症状，同时可伴有肛门疼痛。
7.其他：盆腔炎、膀胱炎、前列腺炎等疾病也可能导致小肚子和肛门连着一起疼。
如果出现小肚子和肛门连着一起疼的症状，建议及时就医，明确病因，并在医生的指导下进行治疗。同时，在治疗期间应注意休息，避免过度劳累，保持肛门清洁卫生，避免食用辛辣刺激性食物。