肛门内肿痛可能由多种原因引起。比如，血栓性外痔可能导致肛门内突发肿痛，这种情况通常是肛门周围皮下静脉破裂出血，形成血栓所致。一般来说，它会在数小时内出现明显肿痛。
常见原因一：痔疮相关
内痔脱出嵌顿： 当内痔发展到一定程度，脱出肛门外后无法回纳，就会引起肛门内肿痛，还可能伴有便血等症状。多见于长期便秘、久坐久站的人群。外痔发炎： 外痔如果受到刺激发炎，会出现肛门内肿痛，疼痛程度不一，有的还会伴有肛门坠胀感。比如食用辛辣食物、饮酒后容易诱发。
常见原因二：肛周脓肿
肛腺感染引发： 肛腺感染是导致肛周脓肿的主要原因，细菌感染肛腺后，炎症蔓延形成脓肿，会出现肛门内持续性肿痛，而且肿痛会逐渐加重，还可能伴有发热等全身症状。一般脓肿形成需要1 - 2周左右时间。位置与症状： 肛周脓肿发生在肛门内周围，肿痛部位比较固定，按压时疼痛明显，随着病情发展，脓肿成熟后可能会自行破溃。
常见原因三：肛裂
长期便秘引起： 长期便秘的人，大便干结粗硬，排便时容易撑裂肛管皮肤，从而导致肛门内肿痛，这种疼痛往往在排便时最为剧烈，便后还可能有短暂缓解但随后又会再次疼痛，同时伴有便血，血量一般较少。伤口特点： 肛裂的伤口多呈梭形或椭圆形，位于肛管后正中部位较为常见。