直肠腺癌的治疗方法主要包括手术治疗、放疗和化疗等。手术治疗是直肠腺癌的主要治疗手段，早期直肠腺癌通过手术有很大的治愈可能。例如，对于早期直肠腺癌患者，根治性手术切除后5年生存率较高。
手术治疗
根治性手术： 是治疗直肠腺癌的重要方式，包括经腹会阴联合直肠癌根治术（Miles手术），适用于距肛缘7cm以内的直肠腺癌。该手术需切除直肠、肛管、肛提肌、坐骨直肠窝内组织及肛门周围皮肤等，然后做永久性结肠造口。局部切除术： 适用于早期瘤体小、分化程度高的直肠腺癌。手术切除肿瘤及其周围部分肠壁组织，术后需密切随访，观察有无复发情况。
放疗
术前放疗： 可以缩小肿瘤体积，降低肿瘤分期，提高手术切除率，减少术后复发风险。一般在手术前进行2 - 4周的放疗，剂量通常为45 - 50Gy。术后放疗： 适用于手术切除不彻底，或病理检查发现有淋巴结转移等情况的患者。通过放疗杀死残留的癌细胞，降低局部复发率。
化疗
辅助化疗： 用于手术前后，帮助杀灭可能存在的微转移病灶。常用的化疗药物有5 - 氟尿嘧啶、奥沙利铂等。对于Ⅱ期和Ⅲ期的直肠腺癌患者，术后通常需要进行辅助化疗，一般持续6个月左右。新辅助化疗： 对于局部晚期的直肠腺癌患者，术前进行化疗可以使肿瘤缩小，增加手术根治性切除的机会。化疗方案多采用联合化疗，如氟尿嘧啶联合奥沙利铂的方案等。
靶向治疗
抗血管生成靶向药物： 如贝伐珠单抗等，通过抑制肿瘤血管生成，阻断肿瘤的营养供应，从而抑制肿瘤生长和转移。在直肠腺癌的治疗中，与化疗联合使用可以提高治疗效果。表皮生长因子受体抑制剂： 例如西妥昔单抗等，针对肿瘤细胞表面的表皮生长因子受体发挥作用，抑制肿瘤细胞的增殖和转移，但需要检测患者的相关基因状态来选择合适的患者。