阿莫西林和头孢都是常用的抗生素，而对于咳嗽应选择吃头孢还是阿莫西林，需综合考虑咳嗽病因、用药个体差异和敏感性、咳嗽症状以及细菌培养和药敏试验等因素，且都要在医生指导下用药，同时要注意头孢是一大类药物，包含很多具体种类。具体如下：
一、咳嗽病因：
1.若咳嗽是由普通细菌感染引起，两者都可选用，通常阿莫西林胶囊可作为首选。但需注意若是病毒感染引起的咳嗽，则需服用抗病毒药物，阿莫西林和头孢都不能用。
二、用药个体差异和敏感性：
1.用药前提是不过敏，阿莫西林属于青霉素类，所以要对青霉素不过敏才行；头孢是一大类抗生素，包括多种具体药物，也需要确定不过敏才可应用。
2.然后要选择敏感性高的那种抗生素。
三、咳嗽症状：
1.如果咳嗽症状轻微，可选择阿莫西林；若症状相对严重，服用阿莫西林无法缓解甚至加重时，可选择头孢类药物，阿莫西林更适合症状早期服用，头孢则更适合症状严重些时服用。
四、细菌培养药敏试验：
通过细菌培养出细菌后，将阿莫西林和头孢放在这些细菌周围，看哪种能抑制或杀灭这些细菌，就选择哪种药物。阿莫西林为半合成广谱青霉素类药，适用于敏感菌所致感染如溶血链球菌、肺炎链球菌、葡萄球菌或流感嗜血杆菌所致中耳炎、鼻窦炎、咽炎、扁桃体炎等上呼吸道感染；头孢类药物临床主要应用于敏感菌所致的肺炎、支气管炎、腹膜炎、胸膜炎以及皮肤和软组织、尿路、胆道、骨及关节、五官、面等部位的感染。
总之，在选择阿莫西林或头孢治疗咳嗽时，要综合多方面因素来考虑，以确保用药的安全和有效性。