食管反流常用的药物有质子泵抑制剂、H2受体拮抗剂和促胃肠动力药等。一般来说，质子泵抑制剂效果较为显著，比如艾司奥美拉唑，通常服用后1-2小时就能起效，可有效抑制胃酸分泌。
质子泵抑制剂：
作用机制： 这类药物能特异性地抑制胃壁细胞内的质子泵，从而阻断胃酸分泌的最后步骤，达到强效抑制胃酸的目的。常见的有奥美拉唑，它可以持续抑制胃酸分泌12小时以上，能很好地缓解食管反流引起的烧心、反酸等症状。适用情况： 适用于症状较严重的食管反流患者，尤其是伴有食管炎的情况。
H2受体拮抗剂：
西咪替丁： 它能竞争性地阻断组胺H2受体，减少胃酸分泌。不过它的作用时间相对较短，一般需要一天服用2-4次。对于轻至中度食管反流患者可以考虑使用，能在一定程度上缓解反酸等症状，但抑制胃酸的强度比质子泵抑制剂稍弱。雷尼替丁： 同样属于H2受体拮抗剂，作用持续时间比西咪替丁长一些，一天服用1-2次即可，也能有效降低胃酸分泌，改善食管反流带来的不适。
促胃肠动力药：
多潘立酮： 它可以促进胃肠道蠕动，加快胃排空，从而减少胃内容物反流至食管的机会。一般在饭前15-30分钟服用，能增强食管蠕动和下食管括约肌张力，缓解反流症状，但对于严重的食管反流可能单独使用效果有限，常与抑酸药联合应用。莫沙必利： 也是一种促胃肠动力药，它通过兴奋胃肠道胆碱能中间神经元及肌间神经丛的5-羟色胺受体，促进乙酰胆碱的释放，增强胃肠道动力，改善食管蠕动功能，促进胃排空，对食管反流有一定的治疗作用，而且不良反应相对较少。