左侧腰腹部内隐隐疼痛可能由多种原因引起，比如泌尿系统结石，其中肾结石较为常见，约10%的人在一生中会患肾结石。
泌尿系统结石导致
肾结石：肾脏内形成的结石会刺激肾盂或输尿管黏膜，引起腰腹部隐痛。结石较小的时候可能会在尿路内移动，刺激尿路黏膜，导致疼痛。患者可能还会伴有血尿，血尿可能是镜下血尿，需要通过尿常规检查发现，也可能是肉眼可见的血尿。输尿管结石：结石如果卡在输尿管中，会引起输尿管痉挛，导致左侧腰腹部剧烈绞痛，但也有部分患者表现为隐隐作痛。输尿管结石可能会造成尿路梗阻，影响尿液排出，时间久了可能导致肾积水，通过B超检查可以发现肾脏集合系统分离。
腰肌劳损引发
长期姿势不良：长时间坐着工作，比如办公室职员，或者长期弯腰劳作的人，腰部肌肉长期处于紧张状态，容易引起腰肌劳损，出现左侧腰腹部隐隐疼痛。一般这种疼痛在劳累后加重，休息后可缓解。运动损伤：运动时如果腰部肌肉拉伤，没有完全恢复，也可能导致左侧腰腹部隐隐不适。比如打篮球、踢足球等运动中突然的腰部扭转动作，容易造成腰肌损伤。
肠道疾病所致
结肠炎：结肠发生炎症时，可能会引起左侧腰腹部隐痛。结肠炎患者还可能伴有腹泻症状，大便次数增多，可能每天3 - 5次甚至更多，大便性状也会改变，可能出现稀便、黏液便等。乙状结肠扭转：乙状结肠过长且系膜过短的人容易发生乙状结肠扭转，会出现左侧腰腹部隐痛，同时伴有腹胀，腹部可摸到胀气的肠袢，随着病情发展，腹胀会逐渐加重。