口腔溃疡常用的有效药物有局部用药和全身用药等。一般来说，局部使用含漱剂、含片等可能较快缓解症状，比如氯己定含漱液，它能在一定程度上抑制口腔内细菌，帮助减轻口腔溃疡带来的不适，通常使用后几分钟到十几分钟就能感觉到局部清爽。
局部外用药物
含漱剂：像氯己定含漱液，它可以起到杀菌消炎的作用，能减少口腔内的细菌滋生，有助于口腔溃疡创面的恢复，一般每天使用2 - 3次，每次含漱10 - 30秒左右。含片：西地碘含片也是常用的，它在口腔内逐渐释放碘，从而发挥杀菌、抗感染的功效，含服时一次1片，一日3 - 5次。
局部涂抹药物
凝胶类药物：复方苯佐卡因凝胶有局部止痛的作用，能快速缓解口腔溃疡带来的疼痛，在溃疡表面涂抹适量即可，但要注意如果对其中成分过敏则不能使用。散剂：冰硼散也是传统的治疗口腔溃疡的散剂，它有清热解毒、消肿止痛的作用，使用时将适量散剂涂抹在溃疡面上，不过儿童使用时要格外小心，避免误吞。
全身用药
维生素类药物：如果是因缺乏维生素引起的口腔溃疡，可以补充维生素B2等。一般成人每天补充维生素B2的剂量在5 - 10毫克左右，但具体用量需遵医嘱，长期缺乏维生素可能会导致口腔溃疡反复发生，所以通过补充维生素来预防和辅助治疗有一定效果。免疫调节剂：对于反复发生且比较严重的口腔溃疡，可能会用到免疫调节剂，如转移因子等，但这类药物需要在医生的严格评估下使用，因为它有一定的适应证和禁忌证，比如免疫功能低下的人群可能会考虑使用，但具体要根据患者的整体健康状况来定。需要注意的是，不同的口腔溃疡情况适用的药物不同，而且儿童使用药物时要特别谨慎，比如儿童使用含漱剂时要防止误吞，一定要在成人监护下使用。如果口腔溃疡长时间不愈合或者反复发作，一定要及时就医，而不是自行盲目用药。