口腔溃疡的治疗药物需根据具体情况选择，一般来说，局部用药效果较好。比如西地碘含片，它可以杀菌抗感染，促进溃疡愈合，通常一次含服1片，一天3-5次。
局部用药为主
含漱类药物： 氯己定含漱液是常用的含漱剂，它能有效抑制口腔内的细菌，减少炎症，一般每天含漱2-3次，每次含漱10-20毫升，含漱后不要立即喝水或进食。贴膜类药物： 醋酸地塞米松粘贴片可以起到抗炎、抗过敏的作用，将贴片贴于溃疡处，一次1片，一日总量不超过3片，能缓解疼痛并促进溃疡愈合。
全身用药情况
维生素类药物： 当口腔溃疡是由于缺乏维生素引起时，可以补充维生素B2等。一般成人每天补充维生素B2的剂量约为5-10毫克，但要注意如果是疾病导致的缺乏，需在医生指导下调整剂量，儿童的补充量则根据年龄有所不同，比如6-12岁儿童每天约需2-5毫克。免疫调节类药物： 对于反复复发且较为严重的口腔溃疡，可能会用到免疫调节药物，如转移因子口服液等。转移因子可以调节机体免疫功能，但儿童使用时需谨慎，要根据体重等因素来考虑用量，一般建议在医生评估后使用。
特殊人群注意事项
儿童口腔溃疡： 儿童口腔溃疡多与缺乏维生素、感染等有关。局部用药时要注意药物的安全性，像儿童使用氯己定含漱液需稀释后使用，避免误吞。如果是婴儿，家长要更加小心操作。对于儿童补充维生素类药物，也要在医生指导下进行，不能自行过量补充。孕妇口腔溃疡： 孕妇出现口腔溃疡时，局部用药相对安全些，如可使用较为温和的含漱液等。全身用药要特别谨慎，因为很多药物可能会对胎儿产生影响，所以孕妇出现口腔溃疡最好先通过局部护理等非药物方式缓解，如保持口腔清洁、多吃富含维生素的食物等，如果情况严重需在医生评估后再考虑是否使用药物及选择合适的药物。