食管炎的治疗药物选择需根据具体类型等因素来定，一般抑制胃酸分泌的药物应用较广泛，比如质子泵抑制剂中的奥美拉唑，通常规范用药能较快缓解症状。
抑制胃酸分泌类药物
质子泵抑制剂：像奥美拉唑、兰索拉唑等属于此类药物。它们能强效抑制胃酸分泌，可减少胃酸对食管黏膜的刺激，一般用药后数小时到1 - 2天内，能缓解烧心、反酸等常见食管炎症状。不过，孕妇及对该类药物过敏者要慎用。H₂受体拮抗剂：例如雷尼替丁、法莫替丁等。这类药物通过抑制组胺刺激胃酸分泌，对轻至中度食管炎有一定疗效，起效相对质子泵抑制剂稍慢些，一般用药1 - 3天可见症状改善，但严重肝肾功能不全者需遵医嘱调整用药。
保护食管黏膜类药物
铝碳酸镁：它能中和胃酸，还可在食管黏膜表面形成保护屏障，减轻胃酸、胆汁等对食管黏膜的损伤，服用后半小时左右可能就有症状缓解，比如能减轻吞咽疼痛等情况。但严重肾功能不全者长期大剂量服用可能有铝蓄积风险，需留意。硫糖铝：可在溃疡面或炎症黏膜表面形成保护膜，促进黏膜修复，一般服用后1 - 2小时起效，能缓解食管炎引起的不适，但便秘患者使用时要谨慎，可能加重便秘症状。
促进胃肠动力类药物
多潘立酮：能增强食管下括约肌张力，促进胃排空，减少胃内容物反流至食管，一般用药后15 - 30分钟开始发挥作用，约1 - 2小时达到药效高峰，可缓解因胃排空延迟导致的反流性食管炎相关症状。不过，心律失常者、接受化疗的肿瘤患者等要慎用该药物。莫沙必利：也是促进胃肠动力的药物，能促进乙酰胆碱释放，增强胃肠道蠕动，改善食管蠕动功能和胃排空，从而减轻反流症状，起效时间大概在半小时左右，但是胃肠道出血、肠梗阻或穿孔者禁用。