治结膜炎的眼药水有多种，常见的如抗生素类眼药水，像氧氟沙星滴眼液，主要用于细菌感染引起的结膜炎，能抑制细菌生长繁殖。一般来说，使用这类眼药水时要注意，开启后尽量在1个月内用完，避免药物变质。
按病因分类的眼药水
细菌性结膜炎用的眼药水
氧氟沙星滴眼液： 它通过抑制细菌DNA旋转酶和DNA复制，从而发挥抗菌作用，可有效治疗由敏感菌引起的细菌性结膜炎。使用时要注意，对喹诺酮类药物过敏者禁用。妥布霉素滴眼液： 适用于葡萄球菌属及链球菌属等引起的细菌性结膜炎，能阻碍细菌蛋白质的合成来杀菌。儿童使用时需谨慎，要在医生指导下使用。
病毒性结膜炎用的眼药水
阿昔洛韦滴眼液： 针对单纯疱疹病毒性角膜炎，它能干扰病毒DNA多聚酶，抑制病毒的复制。使用时可能会出现眼部灼烧感等不适，若症状明显需停药就医。更昔洛韦眼用凝胶： 可用于治疗病毒性结膜炎，能阻止病毒DNA的合成和复制。孕妇及哺乳期妇女使用时要权衡利弊，需遵医嘱。
过敏性结膜炎用的眼药水
富马酸依美斯汀滴眼液： 用于缓解过敏性结膜炎的体征和症状，通过拮抗组胺受体来发挥作用。使用后可能会有头痛、苦味等不良反应，若出现严重不适要及时处理。色甘酸钠滴眼液： 能稳定肥大细胞，抑制肥大细胞释放组胺、白三烯等致敏物质，从而预防过敏性结膜炎的发作。儿童使用时要在成人监护下使用。