功能性子宫出血是由于神经内分泌系统功能失调导致的异常子宫出血，其引起原因较多。比如，内分泌失调是常见因素之一，下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴的调节功能紊乱，可能导致雌激素和孕激素分泌失衡，从而引发功能性子宫出血。
内分泌失调因素：
下丘脑 - 垂体功能异常： 当下丘脑分泌的促性腺激素释放激素分泌失调，或者垂体分泌的促性腺激素异常时，都会影响卵巢的正常功能，进而引起子宫出血。例如，长期精神紧张、压力过大等情况，可能干扰下丘脑 - 垂体的正常功能。卵巢功能异常： 卵巢自身的问题也会导致功能性子宫出血。如卵泡发育异常，不能正常排卵，使得雌激素分泌无规律，子宫内膜失去正常的周期性变化，就容易出现子宫出血。
全身性疾病影响：
血液病： 像血小板减少性紫癜、白血病等血液病，会影响人体的凝血功能，导致凝血机制出现障碍，从而引发子宫出血。比如血小板减少性紫癜患者，由于血小板数量减少，凝血功能受到影响，容易出现子宫异常出血的情况。甲状腺功能异常： 甲状腺功能亢进或减退都会影响内分泌系统，进而波及子宫的正常出血规律。甲状腺功能亢进时，机体代谢加快，可能会影响激素的平衡，导致子宫出血；甲状腺功能减退时，也可能出现内分泌紊乱，引起功能性子宫出血。
子宫局部因素：
子宫内膜息肉： 子宫内膜上生长的息肉会影响子宫的正常收缩和内膜的修复，导致子宫出血。子宫内膜息肉一般是由于局部子宫内膜过度生长形成的，它会干扰子宫的正常生理功能。子宫肌瘤： 尤其是黏膜下子宫肌瘤，会改变子宫腔的形态，影响子宫收缩，使得血管破裂出血，从而引发功能性子宫出血。黏膜下子宫肌瘤向宫腔内生长，就像在子宫腔内多了一个“异物”，影响子宫的正常状态。