卵巢发育不良会对女性的生殖、内分泌等多方面产生影响。一般来说，卵巢发育不良可能导致女性月经异常，比如月经稀发、闭经等情况较为常见，据统计，约30% - 50%的卵巢发育不良女性会出现月经方面的明显改变。
对生殖功能的影响
排卵异常： 卵巢发育不良会影响卵子的正常生成和排出。正常情况下，卵巢每月会有一个优势卵泡发育成熟并排卵，而卵巢发育不良的女性，卵泡发育往往不正常，可能无法正常排卵，这就大大降低了受孕的几率，使得自然怀孕的难度增加。卵子质量差： 即使有卵子排出，其质量也可能不佳。质量差的卵子受精后，胚胎发育异常的风险会升高，容易出现胚胎停育、流产等情况。
对内分泌的影响
雌激素分泌不足： 卵巢能分泌雌激素等重要激素，卵巢发育不良会导致雌激素分泌减少。雌激素对女性的第二性征维持、骨骼健康等都很重要，雌激素不足可能使女性第二性征不明显，像乳房发育不良等，还会影响骨骼代谢，增加骨质疏松的发生风险。内分泌紊乱： 卵巢功能异常会打乱内分泌平衡，可能引发一系列内分泌相关问题，比如出现痤疮、多毛等情况，还可能影响情绪，导致女性出现焦虑、抑郁等情绪波动。
对身体健康的长期影响
心血管疾病风险增加： 由于雌激素具有保护心血管的作用，卵巢发育不良导致雌激素缺乏，会使女性患心血管疾病的风险比正常女性有所升高，比如患冠心病等疾病的几率可能增加。代谢异常： 卵巢功能异常还可能影响代谢，导致脂肪代谢紊乱，容易出现肥胖问题，尤其是腹部肥胖，同时还可能影响糖代谢，增加患糖尿病的潜在风险。