牙龈萎缩通常是由多种原因引起的，比如牙周病就是常见原因之一，有研究显示，成年人中约70%~80%患有不同程度的牙周病，而牙周病很容易导致牙龈萎缩。
口腔卫生不良导致
菌斑堆积： 如果平时不注意口腔清洁，牙齿表面就会堆积菌斑。菌斑是一种无色的细菌薄膜，它会持续刺激牙龈组织，时间长了就会引发牙龈炎症，进而导致牙龈萎缩。比如每天刷牙不认真，牙缝里、牙齿表面残留的食物残渣就会被细菌利用，形成菌斑。牙石刺激： 菌斑如果没有及时清除，会逐渐钙化形成牙石。牙石比菌斑更坚硬，会持续刺激牙龈，使得牙龈红肿、出血，长期下去就会造成牙龈萎缩。牙石一般几个月就会逐渐形成，尤其是口腔卫生差的人更容易出现。
刷牙方法不当引发
横向刷牙： 很多人刷牙时习惯横向用力刷，这种不正确的刷牙方式会对牙龈造成机械性损伤。长期横向刷牙会使牙龈边缘出现磨损，导致牙龈退缩。比如有些人刷牙时像拉锯一样横向刷，就容易伤害牙龈。牙刷选择不合适： 使用过硬的牙刷也会损伤牙龈。过硬的牙刷刷毛比较粗硬，在刷牙过程中会过度摩擦牙龈，破坏牙龈的正常结构，从而引发牙龈萎缩。一般建议选择软毛牙刷，但是即使是软毛牙刷，如果刷牙方法不对也还是会有问题。
不良修复体影响
不合适的假牙： 如果佩戴的假牙不合适，比如假牙的边缘不贴合、松紧度不合适等，就会不断刺激牙龈组织。长期受到这种不良刺激，牙龈会慢慢萎缩。例如，假牙边缘过长，就会一直摩擦牙龈，导致牙龈发炎萎缩。矫正器不恰当： 在牙齿矫正过程中，如果使用的矫正器不合适，也可能会影响牙龈周围的组织健康，造成牙龈萎缩。比如矫正器施加的力量不当，会改变牙龈周围的受力情况，进而引发牙龈萎缩。
全身性疾病因素
糖尿病： 糖尿病患者由于血糖控制不佳，身体的抵抗力会下降，口腔内的细菌更容易滋生，容易引发牙周组织的感染，从而导致牙龈萎缩。研究发现，糖尿病患者发生牙龈萎缩的概率比非糖尿病患者要高很多。内分泌紊乱： 比如女性在孕期、经期等特殊时期，体内激素水平发生变化，也可能影响牙龈的健康，增加牙龈萎缩的风险。孕期女性由于激素变化，牙龈对局部刺激的反应会增强，更容易出现牙龈炎症和萎缩。