上呼吸道感染多由病毒引起，常用的治疗药物有以下几类。一般来说，针对症状缓解的药物应用较为常见。
对症治疗药物
解热镇痛药：常用的有对乙酰氨基酚，它可以缓解发热、头痛、肌肉酸痛等症状，成人及12岁以上儿童常用剂量下相对安全，但3岁以下儿童使用需谨慎，要在医生指导下根据体重等情况使用。布洛芬也可用于退热、止痛，6个月以上儿童可使用布洛芬混悬液等剂型，不过有消化道溃疡病史的患者要慎用。减轻鼻充血药物：像伪麻黄碱，能减轻鼻腔黏膜充血，缓解鼻塞症状，但有高血压、心脏病等基础疾病的患者需遵医嘱使用，因为可能会引起血压升高等不良反应。
抗病毒药物
常见抗病毒药：对于流感病毒引起的上呼吸道感染，可使用奥司他韦，它能抑制流感病毒神经氨酸酶的活性，从而阻止病毒释放，一般在流感症状出现48小时内使用效果较好，不过对药物成分过敏者禁用。扎那米韦也是抗流感病毒药物，适用于成人和7岁及以上儿童的流感治疗，但哮喘患者使用时需注意可能诱发支气管痉挛。
中成药
清热解毒类：例如银翘解毒片，具有疏风解表、清热解毒的作用，可缓解上呼吸道感染引起的发热、头痛、咳嗽、口干、咽喉疼痛等症状。连花清瘟胶囊也有清瘟解毒、宣肺泄热的功效，对于发热或高热、恶寒、肌肉酸痛、鼻塞流涕、咳嗽等症状有一定缓解作用，但脾胃虚寒者慎用。上呼吸道感染大多为自限性疾病，多数患者通过适当休息、对症治疗等可在1周左右恢复。但如果症状持续不缓解或加重，如高热持续不退、咳嗽加重伴咳痰带血等，应及时就医，进一步明确病因并调整治疗方案。