上呼吸道感染多由病毒引起，常用的治疗药物有对症治疗药物和抗病毒药物等。一般来说，对症治疗的药物能缓解相应症状，而抗病毒药物针对特定病毒起作用。
对症治疗药物
解热镇痛药：
非甾体抗炎药类： 对乙酰氨基酚较为常用，它能通过抑制前列腺素合成来发挥解热、镇痛作用，适用于多数上呼吸道感染伴有发热、头痛、肌肉酸痛的患者，一般没有严重的胃肠道刺激风险，但过量服用可能损伤肝脏，不过正常剂量下相对安全。布洛芬也属于这类药物，它除了解热镇痛，还能抗炎，退热作用相对持久，不过有消化道溃疡病史的人要慎用，因为可能加重溃疡。
减轻鼻充血药：
伪麻黄碱： 可以收缩鼻黏膜血管，减轻鼻充血引起的鼻塞症状。比如一些复方感冒药中会含有伪麻黄碱成分，能让鼻子通气更顺畅，但有高血压、心脏病的患者要谨慎使用，因为可能会引起血压升高、心跳加快等不良反应。
抗病毒药物
流感病毒专用药：
奥司他韦： 对于甲型和乙型流感病毒有抑制作用，如果上呼吸道感染是流感病毒引起的，在发病48小时内使用奥司他韦，可以缩短病程，减轻症状。不过它可能会有恶心、呕吐等胃肠道不适的副作用，而且需要在医生的指导下使用，不能自行随意服用。
其他病毒相关药物：
目前针对普通感冒病毒的特效抗病毒药物相对较少，一般以对症治疗为主，因为普通感冒大多是自限性疾病，靠自身免疫力也能逐渐恢复，主要还是通过缓解症状来让患者舒适度过病程。
中成药
清热解毒类：
银翘解毒片： 具有辛凉解表、清热解毒的功效，适用于上呼吸道感染属于风热感冒证型的患者，症状表现为发热、头痛、咳嗽、口干、咽喉疼痛等。它是由金银花、连翘、薄荷等多种中药组成，相对副作用较小，但对该药物成分过敏者禁用。
辛温解表类：
感冒清热颗粒： 适用于上呼吸道感染属于风寒感冒证型的患者，症状为头痛发热、恶寒身痛、鼻流清涕、咳嗽咽干等。其成分有荆芥穗、薄荷、防风等，一般比较安全，但服用期间要忌烟、酒及辛辣、生冷、油腻食物。