扁桃体化脓和溃疡在病因、症状表现、治疗方式上都有区别。扁桃体化脓多由细菌感染引起，像A组乙型溶血性链球菌是常见致病菌，而扁桃体溃疡可能由创伤、感染、自身免疫等多种因素导致。
病因方面
扁桃体化脓：主要是细菌感染引发，比如金黄色葡萄球菌、肺炎链球菌等致病菌入侵扁桃体，大量繁殖，导致扁桃体出现化脓性炎症，一般起病较急，常因受凉、劳累等机体抵抗力下降时容易发病。扁桃体溃疡：创伤是常见原因，比如进食时被鱼刺等划伤扁桃体；感染因素除了细菌，病毒感染也可能导致溃疡，像疱疹性咽峡炎病毒感染可能引起扁桃体溃疡；自身免疫性疾病也可能累及扁桃体出现溃疡，比如白塞病等。
症状表现方面
扁桃体化脓：患者通常会有明显咽痛，吞咽时疼痛加剧，可能伴有高热，体温可达到39℃甚至更高，扁桃体表面可见黄白色脓性分泌物，扁桃体明显红肿，有时会肿大比较明显，甚至影响呼吸和吞咽。扁桃体溃疡：咽痛相对扁桃体化脓可能没那么剧烈，但局部有溃疡面，溃疡表面可能有渗出物，外观上能看到凹陷的溃疡灶，患者可能会感觉局部有异物感或者刺痛等不适，全身症状相对扁桃体化脓可能没那么严重，除非是严重感染导致的溃疡。
治疗方式方面
扁桃体化脓：一般需要使用抗生素治疗，比如青霉素类抗生素，像阿莫西林等，如果患者对青霉素过敏，可选用头孢类抗生素等，通常需要规范用药10天左右，同时要注意休息、多饮水等一般治疗。扁桃体溃疡：如果是创伤性溃疡，需要去除创伤因素，比如取出鱼刺等，然后局部可以使用促进溃疡愈合的药物，像康复新液等；如果是病毒感染引起的溃疡，主要是对症治疗，比如使用抗病毒药物辅助治疗，但病毒感染多为自限性；如果是自身免疫性疾病导致的溃疡，需要针对原发病进行治疗。