溃疡性结肠炎常用的药物主要有氨基水杨酸制剂、糖皮质激素以及免疫抑制剂等。一般来说，氨基水杨酸制剂中的柳氮磺吡啶是常用药物之一，约70%左右的轻度至中度患者使用后能取得较好效果。
氨基水杨酸制剂
柳氮磺吡啶： 是常用的氨基水杨酸制剂，适用于轻、中度溃疡性结肠炎。它在肠道内分解为磺胺吡啶和5-氨基水杨酸，5-氨基水杨酸可抑制炎症反应。美沙拉嗪： 也是氨基水杨酸制剂，有口服剂型和栓剂、灌肠剂等局部剂型。口服美沙拉嗪对于轻、中度溃疡性结肠炎有治疗作用；栓剂和灌肠剂适用于病变局限在直肠、乙状结肠的患者，能直接作用于病变部位发挥抗炎作用。
糖皮质激素
泼尼松： 属于全身用糖皮质激素，对于氨基水杨酸制剂疗效不佳的中度及重度溃疡性结肠炎患者有较好的抗炎作用。一般开始剂量为每日40 - 60mg，病情控制后逐渐减量。氢化可的松琥珀酸钠： 可用于重度溃疡性结肠炎的静脉给药，能快速发挥抗炎、免疫抑制等作用，缓解患者的急性症状。
免疫抑制剂
硫唑嘌呤： 适用于对糖皮质激素治疗效果不佳或依赖的慢性活动性溃疡性结肠炎患者。它通过抑制免疫反应来发挥作用，一般需要服用3 - 6个月才能看到明显疗效。巯嘌呤： 与硫唑嘌呤作用机制相似，也可用于溃疡性结肠炎的治疗，尤其适用于对硫唑嘌呤不耐受的患者。
生物制剂
英夫利西单抗： 属于生物制剂，主要用于对传统治疗药物（如氨基水杨酸制剂、糖皮质激素、免疫抑制剂）无效、不耐受或有严重并发症的重度溃疡性结肠炎患者。它通过特异性结合肿瘤坏死因子 - α来发挥抗炎作用，但使用前需要进行相关检查评估，并且可能会有感染等不良反应风险。