肛周脓肿主要表现为肛周局部的红肿热痛等症状。一般来说，肛周脓肿发病较急，多数患者在1-3天内症状会明显加重。
局部症状表现
红肿： 肛周皮肤会出现明显的红肿现象，病变部位皮肤温度升高，用手触摸能感觉到局部皮肤发红且肿胀。比如有的患者肛周会出现直径几厘米的红肿区域，边界可能不太清晰。疼痛： 疼痛是比较突出的症状，疼痛程度不一，有的患者是持续性胀痛，有的是跳痛。尤其是在坐着、行走或者排便时，疼痛往往会加剧。例如患者坐着的时候会因为臀部压迫病变部位而感到疼痛明显，排便时粪便刺激肛周也会让疼痛加重。肿块： 可以摸到肛周有肿块形成，肿块质地相对较硬，有一定的压痛。有的肿块比较小，如黄豆大小，有的则可能逐渐增大，甚至像鸡蛋大小。
全身症状表现
发热： 部分患者会出现发热症状，体温一般在38℃左右，有的患者体温可能会更高，达到39℃甚至以上。发热通常是因为局部感染引起的炎症反应导致身体出现的全身性反应。比如有的患者发病后1-2天就开始发热，并且发热持续时间可能会持续数天，如果感染没有得到控制，发热可能会反复出现。寒战： 少数患者在发热的同时可能会伴有寒战，也就是怕冷、发抖的表现，这说明感染可能比较严重，身体的炎症反应比较剧烈。
不同部位肛周脓肿的特殊表现
肛门周围脓肿： 主要表现为肛周持续疼痛，病变处明显红肿，有硬结和压痛，脓肿形成时可有波动感。坐骨直肠窝脓肿： 患者会有较为明显的全身症状，如发热、寒战、乏力等，局部症状是开始为持续胀痛，逐渐发展为明显跳痛，肛周患侧红肿，压痛明显，甚至坐立不安。骨盆直肠窝脓肿： 全身症状较为严重，如高热、乏力、寒战等，局部症状相对不明显，仅有直肠坠胀感，直肠指检可触及直肠壁处有隆起、压痛和波动感。