新生儿便秘可能由以下因素引发：
一、肠道发育异常：如果患儿刚出生后不排胎便，特别是在出生24小时、48小时后仍不排胎便，那首先要检查是不是存在肠道的发育异常，例如先天性无肛等情况。
二、先天性巨结肠、胎粪粘稠：当新生儿拥有正常肛门结构时，其便秘可能和先天性巨结肠或者胎粪粘稠相关。医生通常会先进行通便治疗，若治疗后胎便排出顺利，且能够在48小时内排净，一般就是胎粪粘稠导致；而要是治疗后依旧不能自主排便，那就是先天性巨结肠，这时就需要人工辅助其排便。
三、其他：喂养不耐受可能会以便秘作为首发表现，像牛奶蛋白过敏等因素就能够引起便秘。先天性甲状腺功能低下同样可以引发便秘，可通过追问足跟血结果、复查甲状腺功能等办法，来判断便秘是否由甲状腺功能低下造成。
总结概况提示：新生儿便秘的原因包括肠道发育异常、先天性巨结肠与胎粪粘稠、其他如喂养不耐受和先天性甲状腺功能低下等，需要通过相应检查来准确判断具体原因。