戒烟后咳嗽可能是身体在进行自我修复的表现。一般来说，戒烟后1-3个月内咳嗽症状可能会比较明显。
气道黏膜修复导致的咳嗽
气道纤毛恢复功能： 长期吸烟会损害气道内的纤毛，戒烟后，纤毛会逐渐恢复正常的摆动功能，以清除气道内的异物和分泌物，这个过程中可能会引起咳嗽。通常纤毛恢复正常功能大概需要几周时间，在此期间咳嗽可能会时有发生。气道黏膜更新： 吸烟会使气道黏膜受损，戒烟后，新的黏膜细胞开始生长、更新，旧的受损黏膜脱落过程中可能刺激神经引起咳嗽，这种情况可能会持续数周。
呼吸道敏感性改变引发的咳嗽
神经末梢暴露： 吸烟时烟雾中的有害物质会刺激呼吸道神经末梢，戒烟后，这些受刺激的神经末梢敏感度暂时升高，当气道受到轻微刺激（如冷空气、灰尘等）时，就容易引发咳嗽。例如，在天气变凉时，戒烟者可能比不吸烟者更易因冷空气刺激出现咳嗽。炎症反应调整： 吸烟会导致呼吸道长期处于炎症状态，戒烟后，身体开始调整这种炎症反应，在炎症逐渐消退的过程中，可能会出现咳嗽症状来排出炎症产物等，这个过程可能持续1-2个月。
合并其他呼吸道问题导致的咳嗽
慢性支气管炎的表现： 长期吸烟的人很多都有慢性支气管炎的基础，戒烟后，慢性支气管炎的症状可能会显现出来，其中咳嗽就是常见症状之一。一般有慢性支气管炎基础的吸烟者，戒烟后咳嗽可能会持续较长时间，有的甚至持续数月。气道高反应性延续： 吸烟会使气道高反应性增强，戒烟后，这种高反应性不会马上消失，还会持续一段时间，在这段时间内，只要有一点诱发因素，就容易引起咳嗽，比如闻到刺激性气味等。