功能性消化不良可使用促胃肠动力药，如多潘立酮；抑酸药，如奥美拉唑；抗酸药，如铝碳酸镁等药物来改善症状，但具体用药需根据个体情况，在医生指导下选择。
一、促胃肠动力药
适用于以腹胀、早饱等症状为主的患者。多潘立酮能促进胃肠蠕动，加快胃排空，缓解消化不良引起的不适。但老年人使用时需注意观察，若出现心电图异常等情况应及时就医。
二、抑酸药
对于有烧心、反酸等症状的患者适用。奥美拉唑属于质子泵抑制剂，能抑制胃酸分泌。胃溃疡患者使用时要注意与其他疾病鉴别，儿童一般不建议首选此类强效抑酸药。
三、抗酸药
铝碳酸镁可中和胃酸，快速缓解胃痛、胃灼热等症状。孕妇及肾功能不全者使用时需咨询医生，因为其代谢可能受影响。
四、助消化药
如复方消化酶制剂，适用于消化酶分泌不足引起的消化不良。儿童使用时要根据年龄选择合适的剂型，且应在医生指导下，避免与抗菌药物同时服用影响药效。