拉水样便通常是由多种原因引起的，比如感染性因素，像病毒感染可能导致，其中轮状病毒感染较为常见，尤其在婴幼儿群体中，有数据显示约50%的秋季腹泻是由轮状病毒引起的，主要表现为拉水样便、呕吐、发热等症状；细菌感染也会引发，比如大肠杆菌感染，患者除了水样便，还可能伴有腹痛、发热等。
感染性因素导致
病毒感染：除了轮状病毒，诺如病毒也是常见的引起水样便的病毒。诺如病毒具有高度传染性，可通过污染的食物、水传播，感染后一般12~48小时内出现症状，表现为水样便、恶心、呕吐、腹痛等。细菌感染：除了大肠杆菌，沙门氏菌感染也会引起拉水样便。沙门氏菌常存在于被污染的肉类、蛋类等食物中，感染后除了水样便，还可能有发热、寒战等全身症状。
非感染性因素导致
饮食因素：食用过多生冷食物可能引发水样便。比如大量吃刚从冰箱拿出来的冷饮、生食等，刺激胃肠道，导致胃肠蠕动加快，出现水样便。还有食物过敏也可能导致，有些人对特定食物过敏，如海鲜、牛奶等，食用后肠道发生过敏反应，出现水样便、皮疹等症状。疾病因素：一些肠道疾病会导致水样便，像溃疡性结肠炎，患者除了水样便，还可能有黏液脓血便、腹痛、里急后重等症状，病情可能反复发作。另外，甲状腺功能亢进症也可能引起水样便，因为甲状腺素分泌过多会加快胃肠蠕动，导致排便次数增多，出现水样便。
其他因素导致
药物副作用：某些药物可能有导致水样便的副作用。比如一些抗生素，长时间使用广谱抗生素可能会破坏肠道正常菌群平衡，引起肠道功能紊乱，出现水样便。还有降压药中的利血平，也可能导致胃肠道蠕动加快，出现水样便。腹部受凉：腹部受到寒冷刺激，会使胃肠道血管收缩，影响胃肠道的正常功能，导致胃肠蠕动加快，从而出现水样便。特别是在季节交替时，不注意腹部保暖，更容易发生这种情况。