毛囊炎的克星药物需根据病情来定，一般细菌感染引起的毛囊炎，常用莫匹罗星软膏，它对革兰阳性球菌有很好的抗菌作用，能有效抑制细菌生长，缓解炎症，通常局部涂抹，使用方便，很多患者用后能在数天内看到改善。
细菌感染性毛囊炎常用药
莫匹罗星软膏： 属于外用抗生素，适用于革兰阳性球菌引起的皮肤感染，像金黄色葡萄球菌等导致的毛囊炎，直接涂抹在患处，能抑制细菌蛋白质合成，从而发挥杀菌作用。夫西地酸乳膏： 也是针对细菌感染的外用药物，对引起毛囊炎的常见细菌有良好的抗菌活性，可通过抑制细菌的RNA合成来达到抗菌效果，局部涂抹后能减轻毛囊炎的红肿、疼痛等症状。
真菌感染性毛囊炎用药
酮康唑乳膏： 是抗真菌药物，对于马拉色菌等真菌感染引起的毛囊炎有作用，它能抑制真菌细胞膜麦角固醇的合成，影响真菌细胞膜的结构和功能，从而起到抗真菌功效，使用时均匀涂抹在患处。特比萘芬乳膏： 同样是抗真菌外用制剂，通过抑制真菌角鲨烯环氧化酶，使真菌细胞膜形成受阻，达到抗真菌目的，对真菌感染性毛囊炎有一定疗效。
症状较轻的毛囊炎非药物改善方式
对于症状比较轻微的毛囊炎，保持皮肤清洁很重要，每天用清水清洗患处周围皮肤，保持皮肤干爽，有时候仅通过清洁护理，毛囊炎也能逐渐好转。同时，要注意避免搔抓患处，防止感染进一步加重。另外，饮食上也要注意，少吃辛辣、油腻等刺激性食物，多吃蔬菜水果，保持饮食清淡，这也有助于毛囊炎的恢复。